在质谱鉴定蛋白分析时，经常会遇到3个层次的鉴定：蛋白鉴定、肽段鉴定、修饰鉴定。

    它们是什么关系？怎么才确定1个修饰位点及其修饰被鉴定了？可能不少人并不太清楚 或者 有意或无意未关注。

    我们对上述3个层次的鉴定是分得很清楚的，我们知道哪些是真鉴定，哪些是假阳性。

    以下是某蛋白的某特殊修饰LM被鉴定的结果。横坐标是含有该LM修饰的全部肽段的全部修饰，纵坐标是LM修饰的MS/MS 【b/y】离子匹配率。结果表明，仅1个位点的LM修饰【b/y】离子匹配率低于30%。因此，此蛋白的LM修饰高度可信。

【wkh, 2025-07-29 14:01:05】 【责任人 wkh】 [已阅读 87 次]